Structura primară este dată de aminoacizii care intră în lantul proteic prin formarea legăturilor peptidice.

În proteinele naturale legătura peptidică se stabilește între gruparea carboxilică de la C1 și gruparea aminică de la C2, încît lanțul peptidic va fi format dintr-o succesiune de unități CO-NH-CH, legate cap-cap. La unul din capetele lanțului peptidic se găsește o grupare -NH2 liberă, iar la celălat capăt seaflă o grupare -COOH liberă.